Web Analytics
No module Published on Offcanvas position

CYP2D6 genotype analysis of a Thai population: platform comparison

Category: Genomics
Read Time: 1 min
Hits: 120

 pu

                                               
                                                             เปรียบเทียบเครื่องมือสำหรับการวิเคราะห์จีโนไทป์ CYP2D6 ของประชากรคนไทย

ยีน CYP2D6 อยู่บนโครโมโซม 22 (22q13.1) ซึ่งเป็นตำแหน่งยีนที่มีความหลากหลายสูง (Polymorphic)  ประกอบด้วย 9 exons มี open reading frame  4,383 คู่เบส coding ประกอบด้วย 497 กรดอะมิโน ความแปรปรวนทางพันธุกรรมของยีน CYP2D6 เป็นปัจจัยสำคัญที่ทำให้การตอบสนองต่อยารักษาโรคแตกต่างกัน โดยการกระจายตัวของอัลลีลมีความแตกต่างกันมากในประชากรทั้งตามชาติพันธุ์และตามภูมิศาสตร์

ความสำคัญของยีน CYP2D6

ยีน CYP2D6 มีผลต่อการทำงานของเอนไซม์ในเมบอลิซึมของยาต่างๆ เช่น ยารักษาโรคซึมเศร้า ยาต้านหัวใจเต้นผิดจังหวะ ยารักษาอาการทางประสาท ยาเบต้าบล็อกเกอร์ ยาต้านมะเร็ง เป็นต้น ผู้ป่วยที่มีความบกพร่องในการทำงานของยีน CYP2D6 จะส่งผลโดยตรงต่อการออกฤทธิ์ของยา กล่าวคือหากเป็นยาที่อาศัยการออกฤทธิ์ของเมตาบอไลท์ การบกพร่องของยีน CYP2D6 จะทำให้เกิดเมตาบอไลท์จากยารักษาโรคน้อยลงจนรักษาไม่มีประสิทธิภาพมากพอ ในทางกลับกันหากตัวยาเป็นตัวออกฤทธิ์ก็จะทำให้มีระดับยาในเลือดสูงกว่าปกติ เกิดภาวะเป้นพิษขึ้นได้ ดังนั้นในปัจจุบันการศึกษายีน CYP2D6 จึงสัมพันธ์โดยตรงกับประสิทธิภาพของยาในการเลือกรักษาผู้ป่วย

ตัวอย่างการศึกษา และเครื่องมือ

  • DNA ประชากรไทยที่ไม่เกี่ยวข้องกันจำนวน 920 ตัวอย่าง
  • Genotyping CYP2D6 ด้วย 4 Platform
    1. Luminex xTAG® v3
    2. AmpliChip CYP450 ®test
    3. MassARRAY®
    4. TaqMan SNP real-time PCR

ผลการศึกษา

  • ข้อมูลจากการศึกษาซึ่งเป็นกลุ่มประชากรขนาดใหญ่ทำให้ได้ข้อมูล dataset ขนาดใหญ่ของ CYP2D6 ประกอบด้วย อัลลีล (alleles) และความถี่จีโนไทป์ (genotype frequencies)
  • อัลลีล และคู่ของอัลลีล ที่พบบ่อยได้แก่ CYP2D6 *10, *1, *2, *5, *41 and *1/*10, *10/*10, *2/*10, *5/*10, *10/*41 ตามลำดับ
  • Luminex xTAG® v3 และ TaqMan SNP เป็นการใช้เทคนิค real-time PCR ให้ผลสอดคล้องกัน
  • MassARRAY® ให้ผล copy number แตกต่างจาก Platform อื่นโดยให้ผลของ Copy Number สูงที่สุด


การศึกษานี้เพิ่มความรู้เกี่ยวกับความแปรปรวนของ CYP2D6 และมีส่วนช่วยในการพัฒนาการรักษาในประชากรไทย

 

Reference

ข้อมูลจากงานวิจัย
Chamnanphon, M., Gaedigk, A., Vanwong, N., Nuntamool, N., Hongkaew, Y., Puangpetch, A., & Sukasem, C. (2018). CYP2D6 genotype analysis of a Thai population: platform comparison. Pharmacogenomics, 19(12), 947-960.
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29992861/

 

สามารถอ่านเพิ่มเติมเกี่ยวกับเทคโนยีของ MassARRAY® System  ได้ที่
https://www.lifomics.com/MA.html

Maneesawan Dansawan